Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
COL9A3Q14050 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
COL9A3Q14050 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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