Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC3Q14003 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KCNC3Q14003 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms