Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
C1orf61Q13536 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
C1orf61Q13536 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms