Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TUBB3Q13509 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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