Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TCIRG1Q13488 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TCIRG1Q13488 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
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