Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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