Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SGCGQ13326 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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