Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 221.16■□□□□ 0.985e-7■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.15e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.175e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.235e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.615e-7■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.291e-6■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 RGS12-224ENST00000514268 2751 ntTSL 517.94■□□□□ 0.463e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 RGS12-222ENST00000513784 710 ntTSL 217.15■□□□□ 0.343e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.23e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.365e-16■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.642e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.522e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.282e-7■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 16.6
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TARDBPQ13148 NDUFA10-209ENST00000448880 434 ntTSL 53.5□□□□□ -1.852e-6■■■□□ 16.6
TARDBPQ13148 NAA25-201ENST00000261745 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-7■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 HIRA-204ENST00000464189 560 ntTSL 411.51□□□□□ -0.577e-7■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 PTBP1-219ENST00000621737 1125 ntTSL 519.76■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.072e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.12e-6■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 MED15-201ENST00000263205 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.415e-7■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-203ENST00000414318 2088 ntTSL 519.27■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 TBC1D5-215ENST00000443499 681 ntTSL 510.65□□□□□ -0.71e-6■■■□□ 16.5
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TARDBPQ13148 TBC1D5-211ENST00000430169 492 ntTSL 310.06□□□□□ -0.81e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-229ENST00000497531 672 ntTSL 39.82□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-205ENST00000415814 852 ntTSL 39.21□□□□□ -0.941e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-220ENST00000446863 557 ntTSL 49.09□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-209ENST00000429383 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.131e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-217ENST00000444756 545 ntTSL 46.23□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.441e-6■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 312.73□□□□□ -0.377e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 312.72□□□□□ -0.377e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.67e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 510.25□□□□□ -0.777e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.197e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.27e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.367e-10■■■□□ 16.5
TARDBPQ13148 WAC-212ENST00000448193 506 ntTSL 227.06■■□□□ 1.922e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-211ENST00000442148 759 ntTSL 519.4■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.472e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-207ENST00000420266 784 ntTSL 513.79□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-204ENST00000375646 2176 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.562e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-206ENST00000414108 816 ntTSL 35.06□□□□□ -1.62e-6■■■□□ 16.4
TARDBPQ13148 WAC-208ENST00000424454 1330 ntTSL 25□□□□□ -1.612e-6■■■□□ 16.4
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