Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
GPS1Q13098 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
GPS1Q13098 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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