Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ACACAQ13085 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms