Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSTF3Q12996 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms