Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HSPB3Q12988 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms