Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BNIP1Q12981 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
BNIP1Q12981 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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