Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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FOXF2Q12947 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXF2Q12947 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXF2Q12947 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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