Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SMARCB1Q12824 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMARCB1Q12824 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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