Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMOD3Q0VAK6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMOD3Q0VAK6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms