Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SPOCK1Q08629 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms