Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PUDPQ08623 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PUDPQ08623 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms