Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD51Q06609 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RAD51Q06609 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms