Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSME1Q06323 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms