Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTDSPL2Q05D32 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms