Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC144521.1-201ENST00000607148 956 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TNP2Q05952 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms