Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC18A2Q05940 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms