Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
UBE3AQ05086 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UBE3AQ05086 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms