Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
TOP2BQ02880 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
TOP2BQ02880 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms