Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HOXC5Q00444 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HOXC5Q00444 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms