Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
HBBP68871 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
HBBP68871 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
HBBP68871 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
HBBP68871 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms