Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ARF6P62330 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ARF6P62330 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms