Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
RPS29P62273 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
RPS29P62273 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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