Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HERV-K104P61576 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms