Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVPABLB-1P60509 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ERVPABLB-1P60509 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms