Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
LINC00313P59037 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms