Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RIPK4P57078 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms