Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
UBASH3AP57075 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
UBASH3AP57075 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms