Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GFRA1P56159 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms