Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SUMO3P55854 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms