Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD23AP54725 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD23AP54725 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms