Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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PGGT1BP53609 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PGGT1BP53609 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
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