Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPC3P51654 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPC3P51654 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPC3P51654 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms