Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCT8P50990 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCT8P50990 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms