Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ETV1P50549 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ETV1P50549 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ETV1P50549 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ETV1P50549 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ETV1P50549 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms