Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FNTBP49356 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FNTBP49356 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FNTBP49356 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms