Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ETV4P43268 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ETV4P43268 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms