Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ACTR1BP42025 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ACTR1BP42025 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms