Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms