Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ACTN2P35609 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms