Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms