Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
ABCC1P33527 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ABCC1P33527 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms