Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
OTX2P32243 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms