Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
APOBEC3AP31941 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms